基于“拔河”的HT Chip

喜欢喝冰茶

! x1 `, Z7 a% o- n0 M% E
% Q0 ^1 B$ {+ v6 S( f, m3 l& N& _- i最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
! |" O4 T# Q! l- i5 x- K$ h: ^) [/ r
2 ]/ o. a& [: r( R$ W1 i事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。

, \1 x! Y3 k& T' ^某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

喜欢喝冰茶

% ^( V3 [. i. K  y& h! ^+ {: L* }

martian 发表于 2012-9-15 02:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

. L( P- d  ~+ A: Q  X
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm

6 R1 E# u3 ?; P( Q. m& jMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
2 \0 K: v; e$ B7 q# U这个似乎全文是免费的。
% O; |- ?) w' [) k" w
' ^( A) K5 I3 ^( \! M- z# gBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

3 U- i* t# _  v5 r: F+ h# E5 q
4 R- k# N' S. X( o& w

喜欢喝冰茶

隧道 发表于 2012-9-25 02:05
; R" ~) u" @, s1 N" k' r4 \; @6 e有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
8 y5 F% t; l& g不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
' Z8 I0 f, _9 F) v
, k6 O, P9 q, x- L" s: `慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。