基于“拔河”的HT Chip

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最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
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事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。

: V+ @( s6 c4 d5 n5 H/ Z0 I某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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martian 发表于 2012-9-15 02:37
+ _+ @3 S7 @6 s% `% K有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

" {& y6 M, U' a# A! y7 R9 |2 x0 I) K' DMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
8 f: p$ O& g: L! f) b
9 e  q; R* B% M( w( W% mMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
0 a* {7 O% }! r  b) k. J这个似乎全文是免费的。
# O% F( s! e  @) T- z
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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隧道 发表于 2012-9-25 02:05
1 ^3 Q' _' z8 h有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
4 l7 ~  D0 ^- F  z不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？

. L! {0 h, z; M6 K* d6 M慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。