基于“拔河”的HT Chip

喜欢喝冰茶

; {7 v& }2 C6 s7 T* d
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
+ I) ], g# g+ N
事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。

, O/ Q/ k6 t8 p# z某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

喜欢喝冰茶

% G; [3 ^, n) P' E! y/ N" \5 H' A' W# j

martian 发表于 2012-9-15 02:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm

0 j, a' D& _+ R; w1 A' A& iMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
这个似乎全文是免费的。
$ B+ `+ q( w/ w
  n- }  h) b7 X' GBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
3 Y$ s+ u/ c5 X- Y" I  _9 t4 z; g不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
- |' E" e5 q, J0 y3 z" G
7 D" A2 |9 A3 W: O2 |

喜欢喝冰茶

隧道 发表于 2012-9-25 02:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
2 e0 K3 p$ ?" T  F$ p/ `6 C5 k* x
. b" W: l9 @6 V. R慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。