Lucrezia然后被嫁给Alfonso of Aragon,那不勒斯国王Alfonso II的私生子。这是阿拉贡的费迪南二世的堂弟,阿拉贡的费迪南二世和卡斯蒂利亚的伊莎贝拉一世联手,把摩尔人最后打出西班牙,共同统治西班牙,并建立了日不落帝国之前最大的世界帝国,哥伦布就是在他们共主时代派去发现通往东方的航路,结果意外发现了新大陆。
作为哈布斯堡王朝的一部分,那不勒斯王国不仅“属于”西班牙,还不断与法国勾搭,对教皇国构成很大威胁。Alfonso of Aragon被Cesare派人暗杀后,Lucrezia又嫁给Alfonso d'Este,Ferrara和Modena的大公,Ippolito Il d’Este就是他俩的儿子。
Alexander VI在艺术方面也不含糊,Borgia Apartment是梵蒂冈里最华丽的套间之一,圣彼得大教堂里米开朗琪罗著名的“圣殇”就是在他的任期内完成的。
不过d'Este家族兴旺没多久,到了哈布斯堡王朝时代,花园被哈布斯堡王室接手后,开始失修凋零,很多喷泉都干涸了。19世纪中叶,红衣主教Gustav Adolf von Hohenlohe住在这里,花园和住宅大规模翻修,增加了很多哈布斯堡王朝的标志性双头鹰,但Villa d'Este也开始恢复过去的荣光。