基于“拔河”的HT Chip

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最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。

事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。

某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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martian 发表于 2012-9-15 02:37
9 a2 w0 @" z7 c有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

6 Z/ A6 j- n% \. Y! F
" B5 K  R" u- @1 EMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
" C, I+ [0 e) d" n; U. t
3 D8 g# h: H5 d* wMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
) m8 q, y$ p  ^" @1 [这个似乎全文是免费的。
' u3 i( g5 i! F/ K2 {
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
: B! c. k) z' b. Z8 ^9 j3 H) z3 m不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

6 y1 Q- a8 u" @7 w  `. e
1 v" D" R5 D! U$ K/ O1 J

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隧道 发表于 2012-9-25 02:05
. x9 S& a/ D  |2 v6 \% U2 I, b有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
: a1 I6 w# P" Q6 J8 H2 s
1 l: y5 I7 j& j: h# c慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。