基于“拔河”的HT Chip

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; V( J% \. o1 g1 }( @+ }  u1 N最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。

9 k$ Y% J6 Z4 s9 L8 Q$ H事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。

某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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martian 发表于 2012-9-15 02:37
0 W4 S% M" ^# o) U  D- t% ?5 c有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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# O- E) \. I, C7 T6 j, ~Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
9 U6 h7 U5 @/ ~3 M$ O5 Q
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
4 S3 _7 k/ V* Q/ B这个似乎全文是免费的。
9 O. ^' Q$ ~2 ?2 b9 w) _6 u  z5 u
1 E/ U4 c$ w8 x) u, TBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

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隧道 发表于 2012-9-25 02:05
  _0 D: Y' D3 S3 [# |8 |有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
. R8 b& `/ Z# b$ u不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

5 e. F- ~7 I; v  O8 |7 }$ a6 g. u看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？

% x2 X2 |! ^0 O) x0 G9 P+ u慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。