基于“拔河”的HT Chip

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最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。

9 i" |4 N7 _! I事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。

某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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martian 发表于 2012-9-15 02:37
% W- `+ D& M8 O' q有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

: w) l' K5 r7 v! w: o2 \
+ F/ B8 e% y' r  gMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm

. H; D, x! Y- ~( E3 o- e* e" \( m4 SMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
# J2 u8 D; s! u( I) ~# b3 ^" D这个似乎全文是免费的。

+ K: z+ v: o9 \6 [1 S5 nBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
# k2 ?/ ?$ p) r" V/ L# c不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

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+ j: v/ J  J" }# o* A6 T0 Y7 Y

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隧道 发表于 2012-9-25 02:05
$ G& u' f  X1 |0 P' @. M6 B有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？

" R% V0 H# P1 S/ d/ R6 y, M慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。