爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 8 e6 K7 N* F5 U) n2 @7 D0 j6 O5 J6 ?
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最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
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事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
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某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 + l- Y% |- @5 y! w$ L/ P+ W
martian 发表于 2012-9-15 02:37 " b% I9 U( B. ]0 ?, y+ K
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
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Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm) Y5 D; f9 i9 p0 P; B2 u2 ~
, _1 j7 ]4 X; p3 y0 d2 m0 {
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html/ M# ?5 b  F6 p3 q3 X
这个似乎全文是免费的。
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Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
7 C( P$ ~# j; ^% }9 N4 ]4 Z不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05 , c6 o/ {6 C9 G- M! x" Y
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
4 X8 B/ U+ L4 J+ D" }& L7 J5 r不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

( i3 L& A& `* O. _0 x看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？7 W# W, y" T0 Z
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慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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