爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 . y) G  b# q3 [6 ~& C

1 {/ M6 |5 y- p3 S) v5 W最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。. G+ M. t5 P2 C+ `. Y, \/ _5 ^
5 j! Z; q$ |) l2 A( @
事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
. G$ l7 e2 z% c* f( ?; Q; k) U
  i) V% m1 v+ Q# [2 l6 W2 |某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
4 ?' c' W' l8 \
martian 发表于 2012-9-15 02:37 , ?7 u1 A# u' Y! |6 w$ ?, F5 L
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

/ l7 w/ b2 A0 F, q9 U( G- y$ Z% z0 D1 g9 N5 _) U
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm' H+ ~5 S* [  H& ^: |0 z! U* ?6 V0 G

0 c1 i9 @. l' o9 |3 @6 p) p; iMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
: W6 z  h. k- A0 Y$ M# T  R% L这个似乎全文是免费的。
  u% Z- B) H* V6 c& h
: m& R( o( e1 @& K. G& ^Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
& M% k# \9 F" o; H4 R7 Y不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？8 F2 k- q+ J$ ?

4 v1 Z7 r5 ^. U- H8 S6 g) g0 P6 l, u
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05 ( l" K9 A9 {4 d
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。' _) L  Z% {/ N+ X; H
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
* u' t. X4 N, n5 o  A
看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
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慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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