爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 9 K, ^3 Z0 Q% c8 }4 l, g- i" N
7 P! U) z, E4 L/ ^
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。# U8 d( y. @. @) n
1 B: T5 R% ?6 L/ W, o  t$ }/ @
事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。: T0 O$ `( Z. h* ?
- s7 D/ C$ u: X; l% r" \6 C. X
某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 6 P# `5 v9 V+ `, |: K! Z) b9 ?
martian 发表于 2012-9-15 02:37 3 z; ^8 O: I' a  b5 c% f
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

7 k) p+ }. s  O3 X0 V
+ w" D$ u3 M" j2 }# A9 Z; Y7 W3 MMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
, x2 X, U0 |- }3 U6 a3 G7 t2 F$ i; v6 u+ p) w
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html' v3 I- k; ?; e/ z7 F* I% x$ M
这个似乎全文是免费的。
7 _+ @( G# ?/ K3 [9 E9 D
4 p# z! B$ h  \0 |! ~0 f5 QBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
, p9 v& u1 Z5 V) ?4 i不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？1 x# J8 G" E* K/ M: b" t

/ ^: M% h2 `& d* H  T* a) J9 C8 \: p- }$ _' z2 \8 I- m8 N6 a9 i) \
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05
4 v2 G: ]& P7 @% @1 M9 d有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。4 V' \; Y3 E6 `/ s; a3 q) Y* S
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

. f$ G! y; x# l5 P) m1 w: X0 s看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
  h2 [# p3 d- d9 [$ W
7 W& o/ T: e, n2 b. Z2 D慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



欢迎光临 爱吱声 (http://www.aswetalk.net/bbs/) Powered by Discuz! X3.2