爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 0 x9 E8 j& I+ k/ s! W, k
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最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。) C( I2 c! G# G) P5 z' J, E) ^  E# C
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事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
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6 s7 J3 s, Y4 ]某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
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martian 发表于 2012-9-15 02:37
8 @; F+ c2 Y7 j有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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. y  e" b- N9 N: J5 L+ c3 F2 y6 z, lMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm4 z* M  C: Z  v3 x2 Z/ U3 [' a
% p: g2 h0 Q3 s( K
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
$ o9 [& S- v; L# m5 g' W6 B这个似乎全文是免费的。
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$ k9 a& D) U6 r9 dBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。  {# o( W4 I# R3 F
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？! n2 u9 d/ H1 K# s6 T

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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05 % v% B7 d, W/ K2 q# [: r& h
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。' J9 q- D' q! j# Y7 W
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

. h" N/ v) Q: h1 v  r& T6 N看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
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慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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