爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 + G( g# S4 h$ c& r% v

5 C$ r$ D  [0 h. \1 G' t最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。, H6 E8 f# f( K9 ?! ]3 E0 B  Z) ^
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事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。0 c' J+ I+ T8 L/ ?) V: Z

$ k3 v1 g/ B. F  d5 y7 n某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 3 l( Q8 f4 @% K$ e; u$ @. V+ |2 c. a
martian 发表于 2012-9-15 02:37 0 @+ J& j; U8 ?! z, b6 @) Q- `
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

% ~: T5 T! E# O' `" G  p
0 V& F- U) o0 ?3 d! bMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm+ w6 F8 |4 P) m, M  N

3 t. p6 l. H, ]6 X+ f' ?Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html& B( F6 q+ ]3 f
这个似乎全文是免费的。  ^" U. O% t& ~3 _/ T

1 I6 q/ n4 K+ @; |Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
2 w9 c  O% f7 Y7 |; M. c不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？$ U0 D! m6 B7 ^& x  R
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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05
0 H% L2 E+ W* d5 v有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。8 F" l3 ?  W) U
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
: {& C$ v& k3 D* v; E8 B
看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？9 N# L- C$ ^3 P; U8 _2 i+ J* H% b

2 ?2 J2 a5 b* F# x+ g慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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