爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 5 K, L. e9 ?# S: o+ n
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最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。. |9 I% T! @$ S6 F

7 r7 \( w- N0 b; ]事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
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某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 6 z1 j) U: \% q0 O! T
martian 发表于 2012-9-15 02:37 8 x5 r" @. X# Y2 g4 v5 g6 T( c- j
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm7 r5 [  ~0 q" m' m- y

# w1 O4 i7 y1 g( o" a% LMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
* X2 e$ g6 S1 t5 `& c这个似乎全文是免费的。
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( m4 h; t2 o/ Z6 m$ d$ N4 OBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。4 j3 r' F! C' C4 O) E
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05
- B, H* \- O* h" i4 P" d9 }有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
. _5 O/ \6 ~! H0 n! f不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？( J& `9 ?9 s" ^( O! e8 {

5 B+ B2 _% S' R/ x慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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