爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 4 N1 e2 G& `8 u4 B, d+ M

$ V7 L. `( Y4 L7 i; p; x最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
2 }6 M( P9 l4 j2 P/ J: o0 B* g" O$ L) y1 M. z! i* Z+ L9 m
事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。1 c7 |  f, u$ z- h) ]

- ]" Q" `+ b: d3 B6 u某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 ' s' N- r4 T+ E* J$ w! v6 k
martian 发表于 2012-9-15 02:37
6 x7 n4 e) ~1 k有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

3 k5 H! n$ {: n0 Z9 T3 n' q% P* K8 q" J! N. |2 R. s3 s
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
/ i% U* O/ x! a  H1 s# v3 ?
. n- v$ \" X) l3 G  _3 HMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html6 M! i! q# r4 H0 b; O
这个似乎全文是免费的。
- q0 \. |; u3 e7 S% q: S% ?& b; F+ C3 b" S: Z
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。4 H9 z; s* r3 X  [- `2 O0 b+ H* o, M
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？+ n. t6 s; f6 y6 _+ f# i( p

* h9 Z7 Z, o8 N8 p' a' A7 ~
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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05
. B% X- f5 A  v, {9 `- u; i有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
3 s( [' |  z2 Z! ^% L, [不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

) _! D6 z% ?$ |( v+ ^( G% c看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
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慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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