爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 . v- V/ C# J2 f$ [- j

5 {* K; H3 ?+ O% G: k+ E0 z6 Z最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
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( U, k0 ?. t# A. M5 p' [事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
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( u% h, q6 n2 Z  K某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
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martian 发表于 2012-9-15 02:37
* ?; e! N: P( P. b) [4 u, S. [有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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# Z6 v7 |. e5 e# I& {Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
: v; j; f# X# @) A0 t. S
; u  O: f7 A7 F3 J/ A: U5 m; hMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
6 H, U) {4 [( I: b7 B8 @这个似乎全文是免费的。9 G2 W) R4 Z+ }: m& ~
1 u4 W: R; M1 D5 i8 Z# p3 O2 U
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。  c' k! A6 S( ~8 j6 _
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？" X0 V/ s" b* Q$ w) I
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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05
& B+ w: U' P" K2 i- s有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。$ S5 `* ?7 M% `& m4 E) `& H$ d
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

! m: S$ a, a6 V! ~$ G' Z+ _看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
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慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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