爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 ) ]" k0 W2 x! W9 |  N
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最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。! h3 _/ X% S+ d  R% L# H6 t
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事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
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某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 ( t& t- m) _  J9 d  q: z  m) A
martian 发表于 2012-9-15 02:37 ( d! y  F/ K2 t4 _5 q/ U
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

, }: f; V4 T6 A% C% Y# w; i: ]& p' n: C- u" B) V
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
8 p8 C* x0 k/ h2 c% q; B$ ]  j  N+ A2 O4 v  L# h' s' H' r3 Q
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
) O* j% \3 \- ?7 o" f- D; r这个似乎全文是免费的。5 P; N0 j; P. e. d
, A3 b+ j8 v3 K2 l% N
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
( y. y% {2 c0 A& H, ~0 o3 S5 x不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05 / t" t0 s  n% d2 [3 h& S! _" l+ E
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。, x) H  C4 a4 S5 l" z6 ?' D
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

7 k& ^0 I: }/ V6 E看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？1 E, I; i, q* N9 X' a

+ i9 r; b6 q3 t9 q3 h慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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