爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑
3 \0 e7 I5 |( F- p+ ^: P$ g
) K; C5 s6 c$ j9 I0 }最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
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事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
- R) O1 J1 {$ D/ M! p9 d  K! R3 S7 m- f+ G
某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 6 f2 f+ j, I+ ]- l
martian 发表于 2012-9-15 02:37
- Z$ o/ ?$ G; X( p有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
: Y$ A7 d5 v2 J
" ~5 M' s% u- D0 {
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
2 d& k  R3 ~$ I' Y; l2 K( C$ R- x9 j' H; V
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
; [# b# v6 d) S5 O/ ~! H. s这个似乎全文是免费的。
  {& w% w$ f) U4 k2 n* r  P! C$ E  h7 ~- t5 F# U: u
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。, J! Z6 Z! w# R. _9 ?2 G. O
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05
' v  M4 ?/ ?6 G6 {& A. |有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
0 C9 b: p2 ?; z; h/ K! Y不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

5 E1 Z2 o6 ^# ?2 R; G看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？8 r3 Z1 @# u' I7 s/ p# W
. R, K+ l0 y: @! R0 Q5 {5 G
慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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